WES/WGS检测基因突变与对应表型汇总

2024-04-18 06:28

本文主要是介绍WES/WGS检测基因突变与对应表型汇总,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

更新日期:2024年4月17日

1. CYP21A2 - 先天性肾上腺皮质增生

Cytochrome P450 Family 21 Subfamily A Member 2
细胞色素P450家族21亚家族A成员2

该基因编码酶的细胞色素P450超家族的成员。细胞色素P450蛋白是单加氧酶,其催化参与药物代谢和胆固醇、类固醇和其它脂质的合成的许多反应。该蛋白定位于内质网并在21位羟基化类固醇。它的活性是合成类固醇激素包括皮质醇和醛固酮所必需的。该基因的突变会导致先天性肾上腺增生。一个相关的假基因位于该基因附近;涉及功能基因和假基因的基因转换事件被认为是类固醇21-羟化酶缺乏症的许多病例的原因。已发现该基因的两种编码不同同种型的转录变体。

2. STRC - 耳聋

STRC(Stereocilin)是一种蛋白质编码基因。 与STRC相关的疾病包括耳聋、常染色体隐性遗传16和耳聋-不育综合征。 其相关的途径包括声音的感觉处理和嗅觉信号通路。 该基因的一个重要部分是OTOA。该基因编码一种与内耳感觉毛细胞的毛束相关的蛋白质。毛束由称为静纤毛的硬微绒毛组成,并涉及声波的机械感受。该基因是15号染色体上串联重复的一部分;第二个拷贝是假基因该基因的突变导致常染色体隐性遗传性非综合征性耳聋

3. PMS2 - 非息肉病性结直肠癌

PMS1 Homolog 2, Mismatch Repair System Component
PMS1同系物2,错配修复系统组件

该基因编码的蛋白质是错配修复系统的关键组成部分,其功能是纠正DNA复制和同源重组过程中可能发生的DNA错配和小插入和缺失。该蛋白质与mutL同源物1(MLH 1)基因的基因产物形成异源二聚体以形成MutL-α异源二聚体。MutL-α异二聚体具有核酸内切活性,其在MutS-α和MutS-β异二聚体识别错配和插入/缺失环后被激活,并且是去除错配DNA所必需的。在由该基因编码的蛋白质的C-末端存在DQHA(X)2 E(X)4 E基序,其形成核酸酶的活性位点的一部分。该基因的突变与遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC;也称为Lynch综合征)和Turcot综合征有关

4. SMN1、SMN2 - 脊髓性肌萎缩症

SMN1 - 脊髓性肌萎缩症I型和IV型

Survival Motor Neuron Protein 1
运动神经元生存蛋白1

SMN 1(运动神经元1的生存蛋白,端粒)是一个蛋白质编码基因。 与SMN 1相关的疾病包括脊髓性肌萎缩症I型脊髓性肌萎缩症IV型。 与该基因相关的基因本体(GO)注释包括相同的蛋白质结合和RNA结合。 该基因的一个重要部分是SMN 2。该基因是染色体5q13上500 kb反向重复的一部分。这个重复区域包含至少四个基因和重复元件使其易于重排和缺失。序列的重复性和复杂性也导致难以确定该基因组区域的组织。该基因的端粒和着丝粒拷贝几乎相同,编码相同的蛋白质。然而,这种基因的突变,端粒拷贝与脊髓性肌萎缩症有关;着丝粒拷贝的突变不会导致疾病。着丝粒拷贝可能是由端粒拷贝突变引起的疾病的修饰剂。SMN1和SMN2两个基因之间的关键序列差异是外显子7中的单个核苷酸,其被认为是外显子剪接增强子

注意,端粒和着丝粒拷贝的九个外显子历史上被指定为外显子1、2a、2b和3-8。据认为,基因转换事件可能涉及这两个基因,导致每个基因的拷贝数不同。由该基因编码的蛋白质定位于细胞质和细胞核。

SMN2 - 脊髓性肌萎缩I型和III型

Survival Of Motor Neuron 2, Centromeric
运动神经元的生存2蛋白,着丝粒

SMN 2(Survival Of Motor Neuron 2, Centromeric)是一种蛋白质编码基因。 与SMN 2相关的疾病包括脊髓性肌萎缩III型脊髓性肌萎缩I型。 其相关途径包括传染病和SARS-CoV-2感染。 与该基因相关的基因本体(GO)注释包括相同的蛋白质结合和RNA结合。 该基因的一个重要同源基因是SMN 1。

5. FMR1 - 脆性X综合征

Fragile X Messenger Ribonucleoprotein 1
脆性X信使核糖核蛋白1

FMR 1(Fragile X Messenger Ribonucleoprotein 1)是一个蛋白质编码基因。 与FMR 1相关的疾病包括脆性X综合征卵巢早衰1。 其相关途径包括血清素、焦虑和翻译控制。 与该基因相关的基因本体(GO)注释包括核酸结合和RNA结合。 该基因的一个重要同源基因是FXR1

由该基因编码的蛋白质结合RNA并与多聚核糖体结合。编码的蛋白质可能参与mRNA从细胞核到细胞质的运输。在5’ UTR中的三核苷酸重复(CGG)通常在6-53个拷贝处发现,但是扩展到55-230个重复是脆性X综合征的原因。三核苷酸重复序列的扩增也可能导致一种形式的卵巢早衰(POF 1)。

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