Slicer学习笔记(六十五) 3DSlicer的医学图像数据增强扩展模块

本文主要是介绍Slicer学习笔记(六十五) 3DSlicer的医学图像数据增强扩展模块,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

1. 医学图像数据增强扩展模块

基于3D Slicer5.1.0 编写了一个测试医学图像的数据增强测试扩展模块。
扩展模块名:DataAugementation
项目地址:DataAugmentation
下载该项目后,可以将该扩展模块添加到3D Slicer的扩展中。
关于如何给3DSlicer 添加扩展可以看我前面的博客 Slicer学习笔记(十八)添加一个python扩展包 。

1.1. 扩展模块UI

共为数据增强模块配置了:平移变换、旋转变换、高斯滤波、高斯噪声、镜像变换、亮度变换、对比度变换、分辨率变换、伽马变换,共九种变换,并且设置了可调参数控件。
请添加图片描述
请添加图片描述

1.2. 数据增强的实现

数据增强的实现,目前底层考虑了batchgenerators、SimpleITK、MONAI三个底层库的实现,还可以添加其他库,比如ITK、VTK等。
希望感兴趣的朋友可以fork代码,完善现有实现,添加其他实现。
请添加图片描述
对于安装后无法直接打开的,可以根据提示安装缺少的依赖库。
比如 batchgenerators,在3D Slicer 的python交互器中输入下面的命令安装依赖库。

pip_install("batchgenerators")

1.3. 数据增强测试

1.3.1. 数据平移变换

数据沿z方向向下平移22.7mm.
在这里插入图片描述

在这里插入图片描述

1.3.3 数据旋转变换

沿x轴旋转58.7°
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

这篇关于Slicer学习笔记(六十五) 3DSlicer的医学图像数据增强扩展模块的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/769730

相关文章

Python标准库datetime模块日期和时间数据类型解读

《Python标准库datetime模块日期和时间数据类型解读》文章介绍Python中datetime模块的date、time、datetime类,用于处理日期、时间及日期时间结合体,通过属性获取时间... 目录Datetime常用类日期date类型使用时间 time 类型使用日期和时间的结合体–日期时间(

使用Python开发一个Ditto剪贴板数据导出工具

《使用Python开发一个Ditto剪贴板数据导出工具》在日常工作中,我们经常需要处理大量的剪贴板数据,下面将介绍如何使用Python的wxPython库开发一个图形化工具,实现从Ditto数据库中读... 目录前言运行结果项目需求分析技术选型核心功能实现1. Ditto数据库结构分析2. 数据库自动定位3

pandas数据的合并concat()和merge()方式

《pandas数据的合并concat()和merge()方式》Pandas中concat沿轴合并数据框(行或列),merge基于键连接(内/外/左/右),concat用于纵向或横向拼接,merge用于... 目录concat() 轴向连接合并(1) join='outer',axis=0(2)join='o

批量导入txt数据到的redis过程

《批量导入txt数据到的redis过程》用户通过将Redis命令逐行写入txt文件,利用管道模式运行客户端,成功执行批量删除以Product*匹配的Key操作,提高了数据清理效率... 目录批量导入txt数据到Redisjs把redis命令按一条 一行写到txt中管道命令运行redis客户端成功了批量删除k

SpringBoot多环境配置数据读取方式

《SpringBoot多环境配置数据读取方式》SpringBoot通过环境隔离机制,支持properties/yaml/yml多格式配置,结合@Value、Environment和@Configura... 目录一、多环境配置的核心思路二、3种配置文件格式详解2.1 properties格式(传统格式)1.

解决pandas无法读取csv文件数据的问题

《解决pandas无法读取csv文件数据的问题》本文讲述作者用Pandas读取CSV文件时因参数设置不当导致数据错位,通过调整delimiter和on_bad_lines参数最终解决问题,并强调正确参... 目录一、前言二、问题复现1. 问题2. 通过 on_bad_lines=‘warn’ 跳过异常数据3

C#监听txt文档获取新数据方式

《C#监听txt文档获取新数据方式》文章介绍通过监听txt文件获取最新数据,并实现开机自启动、禁用窗口关闭按钮、阻止Ctrl+C中断及防止程序退出等功能,代码整合于主函数中,供参考学习... 目录前言一、监听txt文档增加数据二、其他功能1. 设置开机自启动2. 禁止控制台窗口关闭按钮3. 阻止Ctrl +

java如何实现高并发场景下三级缓存的数据一致性

《java如何实现高并发场景下三级缓存的数据一致性》这篇文章主要为大家详细介绍了java如何实现高并发场景下三级缓存的数据一致性,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 下面代码是一个使用Java和Redisson实现的三级缓存服务,主要功能包括:1.缓存结构:本地缓存:使

在MySQL中实现冷热数据分离的方法及使用场景底层原理解析

《在MySQL中实现冷热数据分离的方法及使用场景底层原理解析》MySQL冷热数据分离通过分表/分区策略、数据归档和索引优化,将频繁访问的热数据与冷数据分开存储,提升查询效率并降低存储成本,适用于高并发... 目录实现冷热数据分离1. 分表策略2. 使用分区表3. 数据归档与迁移在mysql中实现冷热数据分

C#解析JSON数据全攻略指南

《C#解析JSON数据全攻略指南》这篇文章主要为大家详细介绍了使用C#解析JSON数据全攻略指南,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 目录一、为什么jsON是C#开发必修课?二、四步搞定网络JSON数据1. 获取数据 - HttpClient最佳实践2. 动态解析 - 快速