一篇五分生信临床模型预测文章代码复现——Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润(九)——Estimate——倒数第二节

本文主要是介绍一篇五分生信临床模型预测文章代码复现——Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润(九)——Estimate——倒数第二节,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

 

之前讲过临床模型预测的专栏,但那只是基础版本,下面我们以自噬相关基因为例子,模仿一篇五分文章,将图和代码复现出来,学会本专栏课程,可以具备发一篇五分左右文章的水平:

本专栏目录如下:

Figure 1:差异表达基因及预后基因筛选(图片仅供参考) 

Figure 2. 生存分析,箱线图表达改变分析(图片仅供参考)

Figure 3. 基因富集分析(图片仅供参考) 

Figure 4.构建临床预测模型(图片仅供参考)

Figure 5.训练集训练模型(图片仅供参考)

Figure 6.测试集测试模型(图片仅供参考) 

Figure 7.外部数据集验证模型(图片仅供参考)

Figure 8.生存曲线鲁棒性分析(图片仅供参考)

FIgure 9.列线图构建,ROC分析,DCA分析(图片仅供参考)

Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润(图片仅供参考)

下面讲一下免疫浸润,主要是xCell包,estimate,cibersort的用法,然后绘制箱线图或者热图。

下面讲一下estimate,首先得准备表达数据和以下两个输入文件:

这篇关于一篇五分生信临床模型预测文章代码复现——Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润(九)——Estimate——倒数第二节的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!


原文地址:
本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.chinasem.cn/article/577123

相关文章

MySQL 添加索引5种方式示例详解(实用sql代码)

《MySQL添加索引5种方式示例详解(实用sql代码)》在MySQL数据库中添加索引可以帮助提高查询性能,尤其是在数据量大的表中,下面给大家分享MySQL添加索引5种方式示例详解(实用sql代码),... 在mysql数据库中添加索引可以帮助提高查询性能,尤其是在数据量大的表中。索引可以在创建表时定义,也可

使用C#删除Excel表格中的重复行数据的代码详解

《使用C#删除Excel表格中的重复行数据的代码详解》重复行是指在Excel表格中完全相同的多行数据,删除这些重复行至关重要,因为它们不仅会干扰数据分析,还可能导致错误的决策和结论,所以本文给大家介绍... 目录简介使用工具C# 删除Excel工作表中的重复行语法工作原理实现代码C# 删除指定Excel单元

SpringBoot整合Sa-Token实现RBAC权限模型的过程解析

《SpringBoot整合Sa-Token实现RBAC权限模型的过程解析》:本文主要介绍SpringBoot整合Sa-Token实现RBAC权限模型的过程解析,本文给大家介绍的非常详细,对大家的学... 目录前言一、基础概念1.1 RBAC模型核心概念1.2 Sa-Token核心功能1.3 环境准备二、表结

Python实现一键PDF转Word(附完整代码及详细步骤)

《Python实现一键PDF转Word(附完整代码及详细步骤)》pdf2docx是一个基于Python的第三方库,专门用于将PDF文件转换为可编辑的Word文档,下面我们就来看看如何通过pdf2doc... 目录引言:为什么需要PDF转Word一、pdf2docx介绍1. pdf2docx 是什么2. by

Jvm sandbox mock机制的实践过程

《Jvmsandboxmock机制的实践过程》:本文主要介绍Jvmsandboxmock机制的实践过程,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录一、背景二、定义一个损坏的钟1、 Springboot工程中创建一个Clock类2、 添加一个Controller

Spring Security介绍及配置实现代码

《SpringSecurity介绍及配置实现代码》SpringSecurity是一个功能强大的Java安全框架,它提供了全面的安全认证(Authentication)和授权(Authorizatio... 目录简介Spring Security配置配置实现代码简介Spring Security是一个功能强

通过cmd获取网卡速率的代码

《通过cmd获取网卡速率的代码》今天从群里看到通过bat获取网卡速率两段代码,感觉还不错,学习bat的朋友可以参考一下... 1、本机有线网卡支持的最高速度:%v%@echo off & setlocal enabledelayedexpansionecho 代码开始echo 65001编码获取: >

Java集成Onlyoffice的示例代码及场景分析

《Java集成Onlyoffice的示例代码及场景分析》:本文主要介绍Java集成Onlyoffice的示例代码及场景分析,本文给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值,需要... 需求场景:实现文档的在线编辑,团队协作总结:两个接口 + 前端页面 + 配置项接口1:一个接口,将o

SpringBoot实现Kafka动态反序列化的完整代码

《SpringBoot实现Kafka动态反序列化的完整代码》在分布式系统中,Kafka作为高吞吐量的消息队列,常常需要处理来自不同主题(Topic)的异构数据,不同的业务场景可能要求对同一消费者组内的... 目录引言一、问题背景1.1 动态反序列化的需求1.2 常见问题二、动态反序列化的核心方案2.1 ht

IDEA实现回退提交的git代码(四种常见场景)

《IDEA实现回退提交的git代码(四种常见场景)》:本文主要介绍IDEA实现回退提交的git代码(四种常见场景),具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录1.已提交commit,还未push到远端(Undo Commit)2.已提交commit并push到