使用R包genomation中的readTranscriptFeatures工具对我的.ded12文件进行处理时,出现错误‘times‘参数不对

本文主要是介绍使用R包genomation中的readTranscriptFeatures工具对我的.ded12文件进行处理时,出现错误‘times‘参数不对,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

问题描述

我查询了很多地方,发现我研究的物种没有组装完整的染色体,因此它的染色体名称不是standard/typical,以下是我的.ded12文件。解决方法,忽略染色体名称

gene_anno =readTranscriptFeatures("genes.bed12",remove.unusual=FALSE, up.flank = 2000, down.flank = 200)

加上remove.unusual=FALSE即可。

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