【题目】2016年全国研究生数学建模竞赛B题 具有遗传性疾病和性状的遗传位点分析

本文主要是介绍【题目】2016年全国研究生数学建模竞赛B题 具有遗传性疾病和性状的遗传位点分析,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

同学给我看了她参加竞赛的题目,我一看,这不巧了吗,我也就看看题目......

人体的每条染色体携带一个DNA分子。在这条双螺旋的长链中,共有约30亿个碱基对,而基因则是DNA长链中有遗传效应的一些片段。在组成DNA的数量浩瀚的碱基对(或对应的脱氧核苷酸)中,有一些特定位置的单个核苷酸经常发生变异引起DNA的多态性,我们称之为位点

DNA长链中,位点个数约为碱基对个数的1/1000

近年来,研究人员大都采用全基因组的方法来确定致病位点或致病基因,具体做法是:招募大量志愿者(样本),包括具有某种遗传病的人和健康的人,通常用1表示病人,0表示健康者。对每个样本,采用碱基(A,T,C,G)的编码方式来获取每个位点的信息(因为染色体具有双螺旋结构,所以用两个碱基的组合表示一个位点的信息);如表1中,在位点rs100015位置,不同样本的编码都是T和C的组合,有三种不同编码方式TT,TCCC。类似地其他的位点虽然碱基的组合不同,但也只有三种不同编码。研究人员可以通过对样本的健康状况和位点编码的对比分析来确定致病位点,从而发现遗传病或性状的遗传机理。

 

这些信息包括这1000个样本的疾病信息、样本的9445个位点编码信息,以及包含这些位点的基因信息。

 

事实上,可以把基因理解为若干个位点组成的集合。

 

问题三、同上题中的样本患有遗传疾病A的信息(phenotype.txt文件)。现有300个基因,每个基因所包含的位点名称见文件夹gene_info中的300个dat文件,每个dat文件列出了对应基因所包含的位点(位点信息见文件genotype.dat)。由于可以把基因理解为若干个位点组成的集合,遗传疾病与基因的关联性可以由基因中包含的位点的全集或其子集合表现出来请找出与疾病最有可能相关的一个或几个基因,

这篇关于【题目】2016年全国研究生数学建模竞赛B题 具有遗传性疾病和性状的遗传位点分析的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/493170

相关文章

MyBatis Plus 中 update_time 字段自动填充失效的原因分析及解决方案(最新整理)

《MyBatisPlus中update_time字段自动填充失效的原因分析及解决方案(最新整理)》在使用MyBatisPlus时,通常我们会在数据库表中设置create_time和update... 目录前言一、问题现象二、原因分析三、总结:常见原因与解决方法对照表四、推荐写法前言在使用 MyBATis

Python主动抛出异常的各种用法和场景分析

《Python主动抛出异常的各种用法和场景分析》在Python中,我们不仅可以捕获和处理异常,还可以主动抛出异常,也就是以类的方式自定义错误的类型和提示信息,这在编程中非常有用,下面我将详细解释主动抛... 目录一、为什么要主动抛出异常?二、基本语法:raise关键字基本示例三、raise的多种用法1. 抛

github打不开的问题分析及解决

《github打不开的问题分析及解决》:本文主要介绍github打不开的问题分析及解决,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录一、找到github.com域名解析的ip地址二、找到github.global.ssl.fastly.net网址解析的ip地址三

Mysql的主从同步/复制的原理分析

《Mysql的主从同步/复制的原理分析》:本文主要介绍Mysql的主从同步/复制的原理分析,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录为什么要主从同步?mysql主从同步架构有哪些?Mysql主从复制的原理/整体流程级联复制架构为什么好?Mysql主从复制注意

java -jar命令运行 jar包时运行外部依赖jar包的场景分析

《java-jar命令运行jar包时运行外部依赖jar包的场景分析》:本文主要介绍java-jar命令运行jar包时运行外部依赖jar包的场景分析,本文给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作... 目录Java -jar命令运行 jar包时如何运行外部依赖jar包场景:解决:方法一、启动参数添加: -Xb

Apache 高级配置实战之从连接保持到日志分析的完整指南

《Apache高级配置实战之从连接保持到日志分析的完整指南》本文带你从连接保持优化开始,一路走到访问控制和日志管理,最后用AWStats来分析网站数据,对Apache配置日志分析相关知识感兴趣的朋友... 目录Apache 高级配置实战:从连接保持到日志分析的完整指南前言 一、Apache 连接保持 - 性

Linux中的more 和 less区别对比分析

《Linux中的more和less区别对比分析》在Linux/Unix系统中,more和less都是用于分页查看文本文件的命令,但less是more的增强版,功能更强大,:本文主要介绍Linu... 目录1. 基础功能对比2. 常用操作对比less 的操作3. 实际使用示例4. 为什么推荐 less?5.

spring-gateway filters添加自定义过滤器实现流程分析(可插拔)

《spring-gatewayfilters添加自定义过滤器实现流程分析(可插拔)》:本文主要介绍spring-gatewayfilters添加自定义过滤器实现流程分析(可插拔),本文通过实例图... 目录需求背景需求拆解设计流程及作用域逻辑处理代码逻辑需求背景公司要求,通过公司网络代理访问的请求需要做请

Java集成Onlyoffice的示例代码及场景分析

《Java集成Onlyoffice的示例代码及场景分析》:本文主要介绍Java集成Onlyoffice的示例代码及场景分析,本文给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值,需要... 需求场景:实现文档的在线编辑,团队协作总结:两个接口 + 前端页面 + 配置项接口1:一个接口,将o

IDEA下"File is read-only"可能原因分析及"找不到或无法加载主类"的问题

《IDEA下Fileisread-only可能原因分析及找不到或无法加载主类的问题》:本文主要介绍IDEA下Fileisread-only可能原因分析及找不到或无法加载主类的问题,具有很好的参... 目录1.File is read-only”可能原因2.“找不到或无法加载主类”问题的解决总结1.File