详细解答T-SNE程序中from sklearn.manifold import TSNE的数据设置,包括输入数据,绘制颜色的参数设置,代码复制可用!!

本文主要是介绍详细解答T-SNE程序中from sklearn.manifold import TSNE的数据设置,包括输入数据,绘制颜色的参数设置,代码复制可用!!,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

在这里插入图片描述

文章目录

  • 前言——TSNE是t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding的缩写
  • 1、可运行的T-SNE程序
  • 2. 实验结果
  • 3、针对上述程序我们详细分析T-SNE的使用方法
    • 3.1 加载数据
    • 3.2 TSNE降维
    • 3.3 绘制点
    • 3.4 关于颜色设置,颜色使用的标签数据的说明c=y
  • 总结


前言——TSNE是t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding的缩写

TSNE是t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding的缩写,它是一个非线性降维算法。

TSNE的主要作用和优点如下:

  • 高维数据投影到低维空间,如二维或三维,实现高维数据的可视化。

  • 相比其他降维方法如PCA,TSNE在保留局部结构信息上的效果更好,尤其适用于高维稠密数据。

  • 它可以很好地区分数据中的簇结构,有利于观察不同类别或类型的数据分布情况

1、可运行的T-SNE程序

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.manifold import TSNE
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib
matplotlib.use('TkAgg')# 加载数据
iris = load_iris()
X = iris.data
y = iris.target# TSNE降维
tsne = TSNE(n_components=2, random_state=0)
X_tsne = tsne.fit_transform(X)# 绘制点
plt.scatter(X_tsne[:,0], X_tsne[:,1], c=y, marker='o', s=5)# 添加图例
plt.legend(iris.target_names)# 添加标题
plt.title("TSNE projection of the Iris dataset")plt.show()

2. 实验结果

在这里插入图片描述

3、针对上述程序我们详细分析T-SNE的使用方法

3.1 加载数据

  • load_iris()函数从sklearn.datasets模块加载鸢尾花数据集,
  • iris包含数据集的特征数据X标签数据y

3.2 TSNE降维

  • TSNE是一种非线性降维算法,用于高维数据的可视化。它可以将高维数据投影到二维或三维空间。

  • TSNE(n_components=2)实例化一个TSNE模型,降维后的维度数设为2

  • random_state=0固定随机数种子,使得结果可重复

  • fit_transform(X)对特征数据X进行降维,返回降维后的新特征X_tsne。

3.3 绘制点

  • X_tsne包含每个样本的二维坐标

  • plt.scatter以(x,y)坐标方式绘制每个点,c=y指定点的颜色

  • marker='o’设置点的形状为圆形

  • s=5控制点的大小

通过TSNE降维,高维数据X被投影到二维空间,得到低维表示X_tsne。然后根据X_tsne和y进行散点图绘制,就可以实现TSNE降维结果的可视化。这是TSNE的标准流程。

3.4 关于颜色设置,颜色使用的标签数据的说明c=y

c=y这行代码的含义和作用是:

  • c参数用于设置散点图中每个点的颜色。

  • y变量包含了样本的类别标签信息。对于鸢尾花数据集来说,y取值为0、1或2,分别表示三种花的类别

  • 当我们设置c=y时,就是根据每个样本在y中的类别标签值,来动态设置这个样本点在散点图中的颜色

  • 具体来说:

    • 如果一个样本的y值为0,那么这个点的颜色就会取颜色映射中的第一个颜色。

    • 如果y值为1,点颜色取第二个颜色。

    • 如果y值为2,点颜色取第三个颜色。

  • 这样每个类别的样本点就会使用不同的颜色来绘制,从而在可视化结果中清晰区分开各个类别。


总结

  • 在科研中,TSNE广泛应用于图像分类、自然语言处理等领域的数据降维和可视化。

  • 比如对神经网络分类结果进行TSNE降维,可以观察不同类别样本在特征空间中的分布,有助于分析模型表现。

  • 对文本语料进行TSNE降维,可以观察词汇在语义空间中的分布,帮助理解语义结构。

  • 对单细胞RNA-seq数据进行TSNE降维,可以观察不同类型细胞在表达空间中的分布,有助于发现新型细胞亚群。

所以总体来说,TSNE通过高效的降维和保留局部结构,有助于科研人员直观观察高维数据的内在结构,分析模型效果,发现数据中的新知识,从而推动科研工作的进展。它为数据可视化和理解提供了重要的工具支持。

这篇关于详细解答T-SNE程序中from sklearn.manifold import TSNE的数据设置,包括输入数据,绘制颜色的参数设置,代码复制可用!!的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/422485

相关文章

Linux下利用select实现串口数据读取过程

《Linux下利用select实现串口数据读取过程》文章介绍Linux中使用select、poll或epoll实现串口数据读取,通过I/O多路复用机制在数据到达时触发读取,避免持续轮询,示例代码展示设... 目录示例代码(使用select实现)代码解释总结在 linux 系统里,我们可以借助 select、

Java集合之Iterator迭代器实现代码解析

《Java集合之Iterator迭代器实现代码解析》迭代器Iterator是Java集合框架中的一个核心接口,位于java.util包下,它定义了一种标准的元素访问机制,为各种集合类型提供了一种统一的... 目录一、什么是Iterator二、Iterator的核心方法三、基本使用示例四、Iterator的工

Java 线程池+分布式实现代码

《Java线程池+分布式实现代码》在Java开发中,池通过预先创建并管理一定数量的资源,避免频繁创建和销毁资源带来的性能开销,从而提高系统效率,:本文主要介绍Java线程池+分布式实现代码,需要... 目录1. 线程池1.1 自定义线程池实现1.1.1 线程池核心1.1.2 代码示例1.2 总结流程2. J

java程序远程debug原理与配置全过程

《java程序远程debug原理与配置全过程》文章介绍了Java远程调试的JPDA体系,包含JVMTI监控JVM、JDWP传输调试命令、JDI提供调试接口,通过-Xdebug、-Xrunjdwp参数配... 目录背景组成模块间联系IBM对三个模块的详细介绍编程使用总结背景日常工作中,每个程序员都会遇到bu

Python中isinstance()函数原理解释及详细用法示例

《Python中isinstance()函数原理解释及详细用法示例》isinstance()是Python内置的一个非常有用的函数,用于检查一个对象是否属于指定的类型或类型元组中的某一个类型,它是Py... 目录python中isinstance()函数原理解释及详细用法指南一、isinstance()函数

Python的pandas库基础知识超详细教程

《Python的pandas库基础知识超详细教程》Pandas是Python数据处理核心库,提供Series和DataFrame结构,支持CSV/Excel/SQL等数据源导入及清洗、合并、统计等功能... 目录一、配置环境二、序列和数据表2.1 初始化2.2  获取数值2.3 获取索引2.4 索引取内容2

JS纯前端实现浏览器语音播报、朗读功能的完整代码

《JS纯前端实现浏览器语音播报、朗读功能的完整代码》在现代互联网的发展中,语音技术正逐渐成为改变用户体验的重要一环,下面:本文主要介绍JS纯前端实现浏览器语音播报、朗读功能的相关资料,文中通过代码... 目录一、朗读单条文本:① 语音自选参数,按钮控制语音:② 效果图:二、朗读多条文本:① 语音有默认值:②

Vue实现路由守卫的示例代码

《Vue实现路由守卫的示例代码》Vue路由守卫是控制页面导航的钩子函数,主要用于鉴权、数据预加载等场景,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面随着... 目录一、概念二、类型三、实战一、概念路由守卫(Navigation Guards)本质上就是 在路

uni-app小程序项目中实现前端图片压缩实现方式(附详细代码)

《uni-app小程序项目中实现前端图片压缩实现方式(附详细代码)》在uni-app开发中,文件上传和图片处理是很常见的需求,但也经常会遇到各种问题,下面:本文主要介绍uni-app小程序项目中实... 目录方式一:使用<canvas>实现图片压缩(推荐,兼容性好)示例代码(小程序平台):方式二:使用uni

JAVA实现Token自动续期机制的示例代码

《JAVA实现Token自动续期机制的示例代码》本文主要介绍了JAVA实现Token自动续期机制的示例代码,通过动态调整会话生命周期平衡安全性与用户体验,解决固定有效期Token带来的风险与不便,感兴... 目录1. 固定有效期Token的内在局限性2. 自动续期机制:兼顾安全与体验的解决方案3. 总结PS