R语言作图——Violin plot with dot (小提琴图+点图)

2023-11-11 04:59

本文主要是介绍R语言作图——Violin plot with dot (小提琴图+点图),希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

原创:黄小仙

小提琴图之前已经画过了,不过最近小仙又看到一种貌美的画法,决定复刻一下。
文献中看到的图如下:

Step1. 绘图数据的准备

首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,建议大家在excel中保存成csv格式。
作图数据如下:

Step2. 绘图数据的读取

data<-read.csv(“your file path”, header = T)
#注释:header=T表示数据中的第一行是列名,如果没有列名就用header=F

Step3. 绘图所需package的安装、调用

library(ggplot2)  
library(reshape2)              
# 注释:package使用之前需要调用

Step4. 绘图

data_melt <- melt(data)
ggplot(data_melt, aes(x = variable , y = value , fill = variable)) +geom_violin(alpha = 0.5,aes(linetype=NA)) + geom_jitter(shape=21,aes(fill=variable),position = position_jitter(width = 0.2))+xlab("Gene")+ylab("Score")+theme_bw()+theme(legend.position = "none")


关于geom_violin()里的linetype
如果不指定linetype,默认会有黑色边框

关于geom_jitter()
若指定jitter里的width=0,效果图如下:
jitter的shape可以有很多种类型

如果指定shape=24,效果图如下:

最近小仙的话痨病可能又犯了,忍不住想啰嗦几句。
最近小仙真的很没空,同时小仙又是一个对自己很宽容的人,本打算这几个月就不更新了。正巧最近看到村上春树的一本书,《当我谈跑步时 我谈些什么》,颇有感慨。本来我对这位作家的了解,仅限于“挪威的森林”这几个字,然而通过“跑步”这本书,意外得知村上从三十多岁高龄开始跑步,如无意外每天长跑,坚持了二十多年,着实有些惊讶。书中的言语小仙早已忘干净,只剩下一个感觉:我再忙,应该也比不上村上春树吧,他可以天天跑,我一个月写一篇总可以吧。
一开始写“R语言作图”,是网上觉得没有简单易懂的教程,就自己尝试创造一个;后来写是想多写几篇文章,获得更多的关注和粉丝;到现在是就像是对自己的考验,看自己能不能坚持。时间更迭,得到了一些帮助,也帮助了一些人,获得了赞同,也收获了举报。也许写文章也是一种长跑,风云变幻、形形色色就是旅程之风景。

(公众号:生信了)

这篇关于R语言作图——Violin plot with dot (小提琴图+点图)的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!


原文地址:https://blog.csdn.net/biocity/article/details/108830105
本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.chinasem.cn/article/387710

相关文章

Go语言中make和new的区别及说明

《Go语言中make和new的区别及说明》:本文主要介绍Go语言中make和new的区别及说明,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录1 概述2 new 函数2.1 功能2.2 语法2.3 初始化案例3 make 函数3.1 功能3.2 语法3.3 初始化

Go语言中nil判断的注意事项(最新推荐)

《Go语言中nil判断的注意事项(最新推荐)》本文给大家介绍Go语言中nil判断的注意事项,本文给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值,需要的朋友参考下吧... 目录1.接口变量的特殊行为2.nil的合法类型3.nil值的实用行为4.自定义类型与nil5.反射判断nil6.函数返回的

Go语言数据库编程GORM 的基本使用详解

《Go语言数据库编程GORM的基本使用详解》GORM是Go语言流行的ORM框架,封装database/sql,支持自动迁移、关联、事务等,提供CRUD、条件查询、钩子函数、日志等功能,简化数据库操作... 目录一、安装与初始化1. 安装 GORM 及数据库驱动2. 建立数据库连接二、定义模型结构体三、自动迁

Go语言代码格式化的技巧分享

《Go语言代码格式化的技巧分享》在Go语言的开发过程中,代码格式化是一个看似细微却至关重要的环节,良好的代码格式化不仅能提升代码的可读性,还能促进团队协作,减少因代码风格差异引发的问题,Go在代码格式... 目录一、Go 语言代码格式化的重要性二、Go 语言代码格式化工具:gofmt 与 go fmt(一)

Go语言中泄漏缓冲区的问题解决

《Go语言中泄漏缓冲区的问题解决》缓冲区是一种常见的数据结构,常被用于在不同的并发单元之间传递数据,然而,若缓冲区使用不当,就可能引发泄漏缓冲区问题,本文就来介绍一下问题的解决,感兴趣的可以了解一下... 目录引言泄漏缓冲区的基本概念代码示例:泄漏缓冲区的产生项目场景:Web 服务器中的请求缓冲场景描述代码

Go语言如何判断两张图片的相似度

《Go语言如何判断两张图片的相似度》这篇文章主要为大家详细介绍了Go语言如何中实现判断两张图片的相似度的两种方法,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 在介绍技术细节前,我们先来看看图片对比在哪些场景下可以用得到:图片去重:自动删除重复图片,为存储空间"瘦身"。想象你是一个

Go语言中Recover机制的使用

《Go语言中Recover机制的使用》Go语言的recover机制通过defer函数捕获panic,实现异常恢复与程序稳定性,具有一定的参考价值,感兴趣的可以了解一下... 目录引言Recover 的基本概念基本代码示例简单的 Recover 示例嵌套函数中的 Recover项目场景中的应用Web 服务器中

Go语言中使用JWT进行身份验证的几种方式

《Go语言中使用JWT进行身份验证的几种方式》本文主要介绍了Go语言中使用JWT进行身份验证的几种方式,包括dgrijalva/jwt-go、golang-jwt/jwt、lestrrat-go/jw... 目录简介1. github.com/dgrijalva/jwt-go安装:使用示例:解释:2. gi

Go 语言中的 Struct Tag 的用法详解

《Go语言中的StructTag的用法详解》在Go语言中,结构体字段标签(StructTag)是一种用于给字段添加元信息(metadata)的机制,常用于序列化(如JSON、XML)、ORM映... 目录一、结构体标签的基本语法二、json:"token"的具体含义三、常见的标签格式变体四、使用示例五、使用

Go语言使用slices包轻松实现排序功能

《Go语言使用slices包轻松实现排序功能》在Go语言开发中,对数据进行排序是常见的需求,Go1.18版本引入的slices包提供了简洁高效的排序解决方案,支持内置类型和用户自定义类型的排序操作,本... 目录一、内置类型排序:字符串与整数的应用1. 字符串切片排序2. 整数切片排序二、检查切片排序状态: