外泌体相关基因肝癌临床模型预测——2-3分纯生信文章复现——5.拷贝数变异及突变图谱(2)

本文主要是介绍外泌体相关基因肝癌临床模型预测——2-3分纯生信文章复现——5.拷贝数变异及突变图谱(2),希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

 

内容如下:

1.外泌体和肝癌TCGA数据下载

2.数据格式整理

3.差异表达基因筛选

4.预后相关外泌体基因确定

5.拷贝数变异及突变图谱

6.外泌体基因功能注释

7.LASSO回归筛选外泌体预后模型

8.预后模型验证

9.预后模型鲁棒性分析

10.独立预后因素分析及与临床的相关性分析

11.列线图,ROC曲线,校准曲线,DCA曲线

12.外部数据集验证

13.外泌体模型与免疫的关系

14.外泌体模型与单细胞测序

########################### 5.拷贝数变异及突变图谱 ############################

下面绘制预后基因的拷贝数变异图谱,首先先从网站上下载拷贝数变异的数据:

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