代谢组数据分析(十九):随机森林构建代谢组预后模型

2024-08-27 12:20

本文主要是介绍代谢组数据分析(十九):随机森林构建代谢组预后模型,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

在这里插入图片描述

介绍

建立胃癌(GC)预后模型时,从队列3中的181名患者中,使用右删失结果数据进行了随机分层抽样,分为训练数据集(n = 121)和测试数据集(n = 60)。训练了一个包含1000棵树的随机生存森林(RSF)模型,根据它们基于排列的特征重要性来选择突出的特征。通过再次训练随机生存模型,并选取28种代谢物,建立了显示出色预测能力(AUROC = 0.832,95% CI:0.697-0.951)的最佳模型,用于预测测试数据集中GC患者的生存结果。

此外,还利用单变量Cox回归分析中与患者结果显著相关的临床特征,包括TNM分期、宏观表现和血管肿瘤栓塞,分别或组合训练RSF模型。还拟合了综合RSF模型(28种代谢物特征与临床参数结合),以预测患者的结果。通过C指数在测试数据集上评估了模型性能。

对于个体结果预测,样本在森林中的每棵树上都按照对数秩检验的分裂标准下降,直到到达一个终端节点。每个终端节点中的数据用于非参数地估计生存和累积危险函数,分别使用Kaplan-Mei

这篇关于代谢组数据分析(十九):随机森林构建代谢组预后模型的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1111651

相关文章

使用Python构建智能BAT文件生成器的完美解决方案

《使用Python构建智能BAT文件生成器的完美解决方案》这篇文章主要为大家详细介绍了如何使用wxPython构建一个智能的BAT文件生成器,它不仅能够为Python脚本生成启动脚本,还提供了完整的文... 目录引言运行效果图项目背景与需求分析核心需求技术选型核心功能实现1. 数据库设计2. 界面布局设计3

深入浅出SpringBoot WebSocket构建实时应用全面指南

《深入浅出SpringBootWebSocket构建实时应用全面指南》WebSocket是一种在单个TCP连接上进行全双工通信的协议,这篇文章主要为大家详细介绍了SpringBoot如何集成WebS... 目录前言为什么需要 WebSocketWebSocket 是什么Spring Boot 如何简化 We

Spring Boot Maven 插件如何构建可执行 JAR 的核心配置

《SpringBootMaven插件如何构建可执行JAR的核心配置》SpringBoot核心Maven插件,用于生成可执行JAR/WAR,内置服务器简化部署,支持热部署、多环境配置及依赖管理... 目录前言一、插件的核心功能与目标1.1 插件的定位1.2 插件的 Goals(目标)1.3 插件定位1.4 核

使用Python构建一个高效的日志处理系统

《使用Python构建一个高效的日志处理系统》这篇文章主要为大家详细讲解了如何使用Python开发一个专业的日志分析工具,能够自动化处理、分析和可视化各类日志文件,大幅提升运维效率,需要的可以了解下... 目录环境准备工具功能概述完整代码实现代码深度解析1. 类设计与初始化2. 日志解析核心逻辑3. 文件处

python生成随机唯一id的几种实现方法

《python生成随机唯一id的几种实现方法》在Python中生成随机唯一ID有多种方法,根据不同的需求场景可以选择最适合的方案,文中通过示例代码介绍的非常详细,需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习... 目录方法 1:使用 UUID 模块(推荐)方法 2:使用 Secrets 模块(安全敏感场景)方法

使用Docker构建Python Flask程序的详细教程

《使用Docker构建PythonFlask程序的详细教程》在当今的软件开发领域,容器化技术正变得越来越流行,而Docker无疑是其中的佼佼者,本文我们就来聊聊如何使用Docker构建一个简单的Py... 目录引言一、准备工作二、创建 Flask 应用程序三、创建 dockerfile四、构建 Docker

基于Python构建一个高效词汇表

《基于Python构建一个高效词汇表》在自然语言处理(NLP)领域,构建高效的词汇表是文本预处理的关键步骤,本文将解析一个使用Python实现的n-gram词频统计工具,感兴趣的可以了解下... 目录一、项目背景与目标1.1 技术需求1.2 核心技术栈二、核心代码解析2.1 数据处理函数2.2 数据处理流程

Python FastMCP构建MCP服务端与客户端的详细步骤

《PythonFastMCP构建MCP服务端与客户端的详细步骤》MCP(Multi-ClientProtocol)是一种用于构建可扩展服务的通信协议框架,本文将使用FastMCP搭建一个支持St... 目录简介环境准备服务端实现(server.py)客户端实现(client.py)运行效果扩展方向常见问题结

详解如何使用Python构建从数据到文档的自动化工作流

《详解如何使用Python构建从数据到文档的自动化工作流》这篇文章将通过真实工作场景拆解,为大家展示如何用Python构建自动化工作流,让工具代替人力完成这些数字苦力活,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起... 目录一、Excel处理:从数据搬运工到智能分析师二、PDF处理:文档工厂的智能生产线三、邮件自动化:

Python数据分析与可视化的全面指南(从数据清洗到图表呈现)

《Python数据分析与可视化的全面指南(从数据清洗到图表呈现)》Python是数据分析与可视化领域中最受欢迎的编程语言之一,凭借其丰富的库和工具,Python能够帮助我们快速处理、分析数据并生成高质... 目录一、数据采集与初步探索二、数据清洗的七种武器1. 缺失值处理策略2. 异常值检测与修正3. 数据