生物信息学数据分析服务

2024-08-24 19:28

本文主要是介绍生物信息学数据分析服务,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

常见个性化分析列表

GEO相关服务
1,芯片数据挖掘。根据芯片类型,计算表达谱,差异基因等
2,高通量测序数据挖掘。根据测序类型,计算表达谱,差异或者peak calling等
3,多组学数据联合分析
4,GEO原始数据上传/下载

TCGA相关服务
1,特定癌症的表达谱,差异分析
2,Cox回归,生存分析
3,预后模型
4,免疫浸润

转录组相关
1,GSEA/GSVA分析
2,CNC共表达网络分析
3,ceRNA网络分析,包括LncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络等
4,WGCNA分析
5,GO,Pathway分析,常规物种和特殊物种
6,蛋白质-蛋白质相互作用分析
7,hub基因分析
8,circRNA同源分析
9,时序表达分析
10,Venn图
11,PCA分析
小RNA相关
1,miRNA靶基因预测
2,miRNA-靶基因网络分析
3,miRNA二级结构分析
4,piRNA靶基因预测
测序服务:miRNA-seq

ChIP、MeDIP相关
1,峰可视化
2,motif分析
3,circos图

MeRIP/m6A相关
1,m6A和RNA-seq联合分析四象限图
2,相关系数
3,peak venn图
4,circos图
5,motif分析
6,metaplot

eccDNA相关
1,eccDNA长度分布
2,motif分析
3,染色体分布
4,不同基因组特征分布

其他联合分析
1,RNA-seq和MeRIP-seq联合分析
2,miRNA-seq和circRNA-seq联合分析
3,mRNA-seq和eccDNA-seq联合分析

个性化作图、分析相关
1,提供论文例图定制开发
2,提供数据,测试程序等

这篇关于生物信息学数据分析服务的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1103390

相关文章

SpringBoot服务获取Pod当前IP的两种方案

《SpringBoot服务获取Pod当前IP的两种方案》在Kubernetes集群中,SpringBoot服务获取Pod当前IP的方案主要有两种,通过环境变量注入或通过Java代码动态获取网络接口IP... 目录方案一:通过 Kubernetes Downward API 注入环境变量原理步骤方案二:通过

如何搭建并配置HTTPD文件服务及访问权限控制

《如何搭建并配置HTTPD文件服务及访问权限控制》:本文主要介绍如何搭建并配置HTTPD文件服务及访问权限控制的问题,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录一、安装HTTPD服务二、HTTPD服务目录结构三、配置修改四、服务启动五、基于用户访问权限控制六、

Python数据分析与可视化的全面指南(从数据清洗到图表呈现)

《Python数据分析与可视化的全面指南(从数据清洗到图表呈现)》Python是数据分析与可视化领域中最受欢迎的编程语言之一,凭借其丰富的库和工具,Python能够帮助我们快速处理、分析数据并生成高质... 目录一、数据采集与初步探索二、数据清洗的七种武器1. 缺失值处理策略2. 异常值检测与修正3. 数据

SpringCloud整合MQ实现消息总线服务方式

《SpringCloud整合MQ实现消息总线服务方式》:本文主要介绍SpringCloud整合MQ实现消息总线服务方式,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐... 目录一、背景介绍二、方案实践三、升级版总结一、背景介绍每当修改配置文件内容,如果需要客户端也同步更新,

linux服务之NIS账户管理服务方式

《linux服务之NIS账户管理服务方式》:本文主要介绍linux服务之NIS账户管理服务方式,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录一、所需要的软件二、服务器配置1、安装 NIS 服务2、设定 NIS 的域名 (NIS domain name)3、修改主

SpringBoot基于配置实现短信服务策略的动态切换

《SpringBoot基于配置实现短信服务策略的动态切换》这篇文章主要为大家详细介绍了SpringBoot在接入多个短信服务商(如阿里云、腾讯云、华为云)后,如何根据配置或环境切换使用不同的服务商,需... 目录目标功能示例配置(application.yml)配置类绑定短信发送策略接口示例:阿里云 & 腾

springboot项目如何开启https服务

《springboot项目如何开启https服务》:本文主要介绍springboot项目如何开启https服务方式,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录springboot项目开启https服务1. 生成SSL证书密钥库使用keytool生成自签名证书将

使用Node.js制作图片上传服务的详细教程

《使用Node.js制作图片上传服务的详细教程》在现代Web应用开发中,图片上传是一项常见且重要的功能,借助Node.js强大的生态系统,我们可以轻松搭建高效的图片上传服务,本文将深入探讨如何使用No... 目录准备工作搭建 Express 服务器配置 multer 进行图片上传处理图片上传请求完整代码示例

Spring LDAP目录服务的使用示例

《SpringLDAP目录服务的使用示例》本文主要介绍了SpringLDAP目录服务的使用示例... 目录引言一、Spring LDAP基础二、LdapTemplate详解三、LDAP对象映射四、基本LDAP操作4.1 查询操作4.2 添加操作4.3 修改操作4.4 删除操作五、认证与授权六、高级特性与最佳

Linux上设置Ollama服务配置(常用环境变量)

《Linux上设置Ollama服务配置(常用环境变量)》本文主要介绍了Linux上设置Ollama服务配置(常用环境变量),Ollama提供了多种环境变量供配置,如调试模式、模型目录等,下面就来介绍一... 目录在 linux 上设置环境变量配置 OllamPOgxSRJfa手动安装安装特定版本查看日志在