两个基因相关性CPTAC蛋白组数据

2024-06-24 11:52

本文主要是介绍两个基因相关性CPTAC蛋白组数据,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

目录

蛋白数据下载

①蛋白数据下载

1,TCGA-选择泛癌数据

 2,TCGA-TCPA

3,CPTAC(非TCGA)

②蛋白相关性分析

1,数据整理

2,蛋白相关性分析

PCAS在线分析


蛋白数据下载

CPTAC蛋白组学数据库介绍及数据下载分析 – 王进的个人网站 (jingege.wang)

①蛋白数据下载

可以下载泛癌蛋白数据:UCSC Xena (xenabrowser.net)

1,TCGA-选择泛癌数据

dataset: protein expression - RPPA进行数据下载

https://tcga-pancan-atlas-hub.s3.us-east-1.amazonaws.com/download/TCGA-RPPA-pancan-clean.xena.gz; Full metadata

蛋白数据为标准化后的数据,存在负值。

TCGA-FI-A2EY-01TCGA-DF-A2KS-01TCGA-A5-A1OH-01TCGA-AX-A2H7-01TCGA-AX-A2HA-01TCGA-A5-A2K4-01TCGA-EY-A2OM-01TCGA-EY-A2ON-01TCGA-E6-A2P8-01TCGA-E6-A2P9-01
ACC12.3750.5006-0.23450.4286-1.098-0.65960.05107-0.8085-0.04372-0.5503

这篇关于两个基因相关性CPTAC蛋白组数据的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1090077

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