习题 3-7 DNA序列(DNA Consesus String) UVa 1368

2024-04-06 00:18

本文主要是介绍习题 3-7 DNA序列(DNA Consesus String) UVa 1368,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

题目大意:
            给m个长度为n的DNA序列,求一个DNA序列到所有序列的总汉明距离最小,汉明距离为不同字符的位置的个数。如果有多个满足题意得序列则取字典序最小的那个。


Input


2
5 8
TATGATAC
TAAGCTAC
AAAGATCC
TGAGATAC
TAAGATGT
4 10
ACGTACGTAC
CCGTACGTAG
GCGTACGTAT
TCGTACGTAA


Output

TAAGATAC
7
ACGTACGTAA
6

实现:

#include<stdio.h>
#include<string.h>
#define maxn 1005
int main(){int t;int m, n;char buf[maxn][maxn];int cnt;char a[maxn];int max[4];int T, A, G, C;int maxmum, index;int k;
//		freopen("C:\\Users\\zhangwei\\Desktop\\input.txt","r",stdin); 
//		freopen("C:\\Users\\zhangwei\\Desktop\\output.txt","w",stdout); scanf("%d",&t);while(t--){cnt = 0;scanf("%d%d",&m,&n);for(int i = 0; i < m; i++ ){scanf("%s",buf[i]);}for(int j = 0; j < n; j++ ){memset(max, 0, sizeof(max));for(int i = 0; i < m; i++ ){if(buf[i][j] == 'A')max[0]++;if(buf[i][j] == 'C')max[1]++;if(buf[i][j] == 'G')max[2]++;if(buf[i][j] == 'T')max[3]++;maxmum = max[0];index = 0;for(k = 1; k < 4; k++){if(max[k] > maxmum){index = k;maxmum = max[k];}} }	cnt += m-maxmum;//这里 可以直接算出 Hamming数量了 char c;if(index == 0) c = 'A';if(index == 1) c = 'C';if(index == 2) c = 'G';if(index == 3) c = 'T';a[j] = c;}a[n] = '\0';// 可以自己设定 '\0'  (也可以按照字符数组来输出) 如果按照 %s 末尾必须 加\0printf("%s\n%d\n",a, cnt);	
// 这是开始相当计算 Hamming值的方法 需要扫描 效率比较低 
//			for(int i = 0; i < m; i++ ){
//				for(int j = 0; j < n; j++ ){
//					if(buf[i][j] != a[j])
//						cnt++;
//				}
//			}
//			printf("%d\n",cnt);} return 0;	} 


题目 要求 Hamming最小 (并且按照字典序) 利用 数组 int a[] 分别按顺序记录 A C G T 数量 求出的自然是字典序

关于字符数组与字符串:
首先由字符数组的特点: 不以字符'\0'为结束标志
由字符串数组特点: 以字符'\0'为结束标志

其次,用printf函数以参数 "%s"输出字符串时过程为:
  • 从首地址开始逐字节寻址,把存储单元(一个字节)内的数据转换为相应数据应具有的的形式(如把二进制数转换为字符‘a’)
  • 直到某一个字节内存的元素为字符'\0'时,输出此字符并且寻址结束。


这篇关于习题 3-7 DNA序列(DNA Consesus String) UVa 1368的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/878533

相关文章

Python的Darts库实现时间序列预测

《Python的Darts库实现时间序列预测》Darts一个集统计、机器学习与深度学习模型于一体的Python时间序列预测库,本文主要介绍了Python的Darts库实现时间序列预测,感兴趣的可以了解... 目录目录一、什么是 Darts?二、安装与基本配置安装 Darts导入基础模块三、时间序列数据结构与

C# LiteDB处理时间序列数据的高性能解决方案

《C#LiteDB处理时间序列数据的高性能解决方案》LiteDB作为.NET生态下的轻量级嵌入式NoSQL数据库,一直是时间序列处理的优选方案,本文将为大家大家简单介绍一下LiteDB处理时间序列数... 目录为什么选择LiteDB处理时间序列数据第一章:LiteDB时间序列数据模型设计1.1 核心设计原则

C++ STL-string类底层实现过程

《C++STL-string类底层实现过程》本文实现了一个简易的string类,涵盖动态数组存储、深拷贝机制、迭代器支持、容量调整、字符串修改、运算符重载等功能,模拟标准string核心特性,重点强... 目录实现框架一、默认成员函数1.默认构造函数2.构造函数3.拷贝构造函数(重点)4.赋值运算符重载函数

redis数据结构之String详解

《redis数据结构之String详解》Redis以String为基础类型,因C字符串效率低、非二进制安全等问题,采用SDS动态字符串实现高效存储,通过RedisObject封装,支持多种编码方式(如... 目录一、为什么Redis选String作为基础类型?二、SDS底层数据结构三、RedisObject

Linux中的自定义协议+序列反序列化用法

《Linux中的自定义协议+序列反序列化用法》文章探讨网络程序在应用层的实现,涉及TCP协议的数据传输机制、结构化数据的序列化与反序列化方法,以及通过JSON和自定义协议构建网络计算器的思路,强调分层... 目录一,再次理解协议二,序列化和反序列化三,实现网络计算器3.1 日志文件3.2Socket.hpp

Java获取当前时间String类型和Date类型方式

《Java获取当前时间String类型和Date类型方式》:本文主要介绍Java获取当前时间String类型和Date类型方式,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,... 目录Java获取当前时间String和Date类型String类型和Date类型输出结果总结Java获取

Spring的RedisTemplate的json反序列泛型丢失问题解决

《Spring的RedisTemplate的json反序列泛型丢失问题解决》本文主要介绍了SpringRedisTemplate中使用JSON序列化时泛型信息丢失的问题及其提出三种解决方案,可以根据性... 目录背景解决方案方案一方案二方案三总结背景在使用RedisTemplate操作redis时我们针对

java String.join()方法实例详解

《javaString.join()方法实例详解》String.join()是Java提供的一个实用方法,用于将多个字符串按照指定的分隔符连接成一个字符串,这一方法是Java8中引入的,极大地简化了... 目录bVARxMJava String.join() 方法详解1. 方法定义2. 基本用法2.1 拼接

利用Python实现时间序列动量策略

《利用Python实现时间序列动量策略》时间序列动量策略作为量化交易领域中最为持久且被深入研究的策略类型之一,其核心理念相对简明:对于显示上升趋势的资产建立多头头寸,对于呈现下降趋势的资产建立空头头寸... 目录引言传统策略面临的风险管理挑战波动率调整机制:实现风险标准化策略实施的技术细节波动率调整的战略价

PostgreSQL 序列(Sequence) 与 Oracle 序列对比差异分析

《PostgreSQL序列(Sequence)与Oracle序列对比差异分析》PostgreSQL和Oracle都提供了序列(Sequence)功能,但在实现细节和使用方式上存在一些重要差异,... 目录PostgreSQL 序列(Sequence) 与 oracle 序列对比一 基本语法对比1.1 创建序