安装开源版pymol、MPEG encoder missing.The FreeMOL add-ons may not be installed.Encoder ‘ffmpeg‘ is not

本文主要是介绍安装开源版pymol、MPEG encoder missing.The FreeMOL add-ons may not be installed.Encoder ‘ffmpeg‘ is not,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

在跟随其他大佬的帖子下载开源版pymol的时候,发现了anaconda版本和pymol版本不兼容的情况,最新的anaconda版本conda下载pymol-2.4.0-cp38-cp38-win_amd64.whl之后,显示出的pymol窗口是这样怪异的版本,命令窗口和图形窗口可以分开,看分子都是正常的,但是导出动画视频的编码器出现了问题(如下图3.、4)

找了很多帖子,补下载什么的都没用,最后在一个学术论坛上找到了答案,不过人家是用的miniconda的环境,我还是继续用的anaconda2023的环境,以此篇日志记录一下

详细下载过程是:进到你想下载pymol的文件夹,打开cmd或者powershell可以试一下

D:\XZY\RJ\Pymol>conda create -n python38 python=3.8   #下载好conda之后要创建python环境,创建了一个存放python环境的单位 ,名为python38 D:\XZY\RJ\Pymol>conda activate python38       #激活python环境,之后打开conda要使用python时都要激活一下(python38)D:\XZY\RJ\Pymol>conda install -c conda-forge pymol-open-source    #下载开源版pymol(python38) D:\XZY\RJ\Pymol>conda install -c conda-forge ffmpeg    #下载ffmpeg的插件
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done==> WARNING: A newer version of conda exists. <==current version: 23.7.4latest version: 23.11.0Please update conda by running$ conda update -n base -c defaults condaOr to minimize the number of packages updated during conda update useconda install conda=23.11.0## Package Plan ##environment location: D:\XZY\RJ\conda\envs\python38added / updated specs:- ffmpegThe following packages will be downloaded:package                    |            build---------------------------|-----------------ffmpeg-4.3.1               |       ha925a31_0        26.2 MB  conda-forge------------------------------------------------------------Total:        26.2 MBThe following NEW packages will be INSTALLED:ffmpeg             conda-forge/win-64::ffmpeg-4.3.1-ha925a31_0Proceed ([y]/n)? yDownloading and Extracting PackagesPreparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done(python38) D:\XZY\RJ\Pymol>conda install -c schrodinger mpeg_encode   #另一个插件
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done==> WARNING: A newer version of conda exists. <==current version: 23.7.4latest version: 23.11.0Please update conda by running$ conda update -n base -c defaults condaOr to minimize the number of packages updated during conda update useconda install conda=23.11.0## Package Plan ##environment location: D:\XZY\RJ\conda\envs\python38added / updated specs:- mpeg_encodeThe following packages will be downloaded:package                    |            build---------------------------|-----------------mpeg_encode-1              |                0          78 KB  schrodinger------------------------------------------------------------Total:          78 KBThe following NEW packages will be INSTALLED:mpeg_encode        schrodinger/win-64::mpeg_encode-1-0The following packages will be UPDATED:ca-certificates    conda-forge::ca-certificates-2023.11.~ --> pkgs/main::ca-certificates-2023.12.12-haa95532_0Proceed ([y]/n)? yDownloading and Extracting PackagesPreparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done(python38) D:\XZY\RJ\Pymol>conda install numpy
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done==> WARNING: A newer version of conda exists. <==current version: 23.7.4latest version: 23.11.0Please update conda by running$ conda update -n base -c defaults condaOr to minimize the number of packages updated during conda update useconda install conda=23.11.0# All requested packages already installed.(python38) D:\XZY\RJ\Pymol>pip install numpy    #检查一下numpy组件有无安装,pip install和conda install 都可以试一下,虽然我不知道区别
Requirement already satisfied: numpy in d:\xzy\rj\conda\envs\python38\lib\site-packages (1.24.3)(python38) D:\XZY\RJ\Pymol>pip install mkl      #检查mkl有无安装
Requirement already satisfied: mkl in d:\xzy\rj\conda\envs\python38\lib\site-packages (2024.0.0)
Requirement already satisfied: intel-openmp==2024.* in d:\xzy\rj\conda\envs\python38\lib\site-packages (from mkl) (2024.0.2)
Requirement already satisfied: tbb==2021.* in d:\xzy\rj\conda\envs\python38\lib\site-packages (from mkl) (2021.11.0)(python38) D:\XZY\RJ\Pymol> python -m pip install pmw   #检查pmw有无安装,这三个组件对于pymol来说是必装的,如果要导出动画,那么上面的ffmpeg也要检查安装
Requirement already satisfied: pmw in d:\xzy\rj\conda\envs\python38\lib\site-packages (2.0.1)

至此,无法导出动画的问题就已解决,可能还是和安装方法有一定关系,我对象不是用的conda环境安装,那个方法就好像会给他把所有组件都装上了,就没有出现ffmpeg编码器不在的情况。

最后,如果需要创建Pymol的快捷打开方式,是在你安装anaconda的文件夹下-envs-python38-scripts-pymol.exe,我之前喜欢直接在conda的文件夹底下下载Pymol,那他就在canda的scripts能找到

这篇关于安装开源版pymol、MPEG encoder missing.The FreeMOL add-ons may not be installed.Encoder ‘ffmpeg‘ is not的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/617105

相关文章

基于Linux的ffmpeg python的关键帧抽取

《基于Linux的ffmpegpython的关键帧抽取》本文主要介绍了基于Linux的ffmpegpython的关键帧抽取,实现以按帧或时间间隔抽取关键帧,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学... 目录1.FFmpeg的环境配置1) 创建一个虚拟环境envjavascript2) ffmpeg-py

gitlab安装及邮箱配置和常用使用方式

《gitlab安装及邮箱配置和常用使用方式》:本文主要介绍gitlab安装及邮箱配置和常用使用方式,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录1.安装GitLab2.配置GitLab邮件服务3.GitLab的账号注册邮箱验证及其分组4.gitlab分支和标签的

MySQL MCP 服务器安装配置最佳实践

《MySQLMCP服务器安装配置最佳实践》本文介绍MySQLMCP服务器的安装配置方法,本文结合实例代码给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值,需要的朋友参考下... 目录mysql MCP 服务器安装配置指南简介功能特点安装方法数据库配置使用MCP Inspector进行调试开发指

在Windows上使用qemu安装ubuntu24.04服务器的详细指南

《在Windows上使用qemu安装ubuntu24.04服务器的详细指南》本文介绍了在Windows上使用QEMU安装Ubuntu24.04的全流程:安装QEMU、准备ISO镜像、创建虚拟磁盘、配置... 目录1. 安装QEMU环境2. 准备Ubuntu 24.04镜像3. 启动QEMU安装Ubuntu4

Python UV安装、升级、卸载详细步骤记录

《PythonUV安装、升级、卸载详细步骤记录》:本文主要介绍PythonUV安装、升级、卸载的详细步骤,uv是Astral推出的下一代Python包与项目管理器,主打单一可执行文件、极致性能... 目录安装检查升级设置自动补全卸载UV 命令总结 官方文档详见:https://docs.astral.sh/

Nexus安装和启动的实现教程

《Nexus安装和启动的实现教程》:本文主要介绍Nexus安装和启动的实现教程,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教... 目录一、Nexus下载二、Nexus安装和启动三、关闭Nexus总结一、Nexus下载官方下载链接:DownloadWindows系统根

Java SWT库详解与安装指南(最新推荐)

《JavaSWT库详解与安装指南(最新推荐)》:本文主要介绍JavaSWT库详解与安装指南,在本章中,我们介绍了如何下载、安装SWTJAR包,并详述了在Eclipse以及命令行环境中配置Java... 目录1. Java SWT类库概述2. SWT与AWT和Swing的区别2.1 历史背景与设计理念2.1.

安装centos8设置基础软件仓库时出错的解决方案

《安装centos8设置基础软件仓库时出错的解决方案》:本文主要介绍安装centos8设置基础软件仓库时出错的解决方案,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐... 目录安装Centos8设置基础软件仓库时出错版本 8版本 8.2.200android4版本 javas

Pytorch介绍与安装过程

《Pytorch介绍与安装过程》PyTorch因其直观的设计、卓越的灵活性以及强大的动态计算图功能,迅速在学术界和工业界获得了广泛认可,成为当前深度学习研究和开发的主流工具之一,本文给大家介绍Pyto... 目录1、Pytorch介绍1.1、核心理念1.2、核心组件与功能1.3、适用场景与优势总结1.4、优

conda安装GPU版pytorch默认却是cpu版本

《conda安装GPU版pytorch默认却是cpu版本》本文主要介绍了遇到Conda安装PyTorchGPU版本却默认安装CPU的问题,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的... 目录一、问题描述二、网上解决方案罗列【此节为反面方案罗列!!!】三、发现的根本原因[独家]3.1 p