【ITK库学习】使用itk库进行图像配准:内插器(插值)

2023-12-23 15:12

本文主要是介绍【ITK库学习】使用itk库进行图像配准:内插器(插值),希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

目录

  • 1、itkNearestNeighborInterpolateImageFunction 最近点插值
  • 2、itkLinearInterpolateImageFunction 线性插值
  • 3、itkBSplineInterpolateImageFunction B样条插值
  • 4、itkWindowedSincInterpolateImageFunction 窗口化Sinc插值
  • 5、itkRayCastInterpolateImageFunction 投射插值
  • 6、itkGaussianInterpolateImageFunction 高斯插值

配准时,参考图像的网格位置没有映射到待配准图像的网格位置时,就需要用差补法来计算待配准图像中非网格位置上的亮度值。在ITK中主要用interpolator类实现,能够插入配准函数中。

配准计算中,差补法会影响最后花的平滑度和总计算时间,因此选择具体的差补方法时要考虑平滑度和计算简化两个方面。

  • ImageFunction::IsInsideBuffer(): 可用于在调用方法之前检查边界,判断物理点是否落在图像像素的空间范围之内。
  • GetRadius():获取插值所需的半径,定义了在给定点处插值所需的周围像素的数量
  • Evaluate(const PointType & point):在点位置对图像进行插值,返回插值图像强度,指定点位置,不进行边界检查,假设该点位于图像缓冲区内
  • EvaluateAtContinuousIndex(const ContinuousIndexType & index):在连续索引位置对图像进行插值,返回指定索引位置处的插值图像强度,不进行边界检查,假设该点位于图像缓冲区内,子类必须重写此方法
  • EvaluateAtIndex(const IndexType& index):在索引位置插入图像,返回指定索引位置处的图像值,不进行边界检查,假设该点位于图像缓冲区内

1、itkNearestNeighborInterpolateImageFunction 最近点插值

该类是标量图像的最近邻像素点插值。

通过复制最近领域的强度来在非整数像素位置插值图像强度,此类根据输入图像类型和坐标表示类型(例如 float 或 double)进行模板化。

该差补法较简单。

模板设置:

typedef itk::NearestNeighborInterpolateImageFunction<InputImageType, double> InterpolatorType ;

2、itkLinearInterpolateImageFunction 线性插值

该类在指定位置线性插值图像。

在非整数像素位置线性插值图像强度,此类根据输入图像类型和坐标表示类型(例如 float 或 double)进行模板化。它的插值亮度是连续的,但是亮度梯度在网格点上是不连续的。

此函数适用于标量和矢量像素类型的图像以及 VectorImage 类型的图像。

模板设置:

typedef  itk::LinearInterpolateImageFunction<InputImageType, double> InterpolatorType ;

3、itkBSplineInterpolateImageFunction B样条插值

该类评估图像的B样条插值。

样条阶数范围是0~5,0:表示几乎和最近插补相同,1:表示和线性插补相同,>1:插补值和它的微分是空间连续的。

B-Spline的系数用递归滤波器BSplineDecompositionImageFilter计算,非网格位置的亮度值 = 亮度*已经改变了B-Spline kernels的系数来计算。

限制:样条线阶数必须在设置图像之前设置样条线阶数,使用镜像边界条件, 每个尺寸都需要相同的样条线顺序,样条线是在所有尺寸中确定的,不能选择性地选择尺寸来计算样条线。

注意:插补值肯定会超出输入图像亮度范围。在处理unsigned的数据时,插补值可能是负的。

  • SetInputImage():设置输入图像
  • Set/GetSplineOrder():获取/设置样条线阶数,0~5之间, 默认为3阶样条
  • Set/GetUseImageDirection():UseImageDirection标志确定是相对于图像网格还是相对于物理空间来计算图像导数;当该标志为 ON 时,将相对于物理空间坐标系计算导数,区别在于是否考虑图像方向,On将考虑图像方向,与Off时执行的计算量相比,将导致额外的矩阵乘法;默认值为“开”
  • SetInterpolationWeights():确定值 x 插值的权重
  • SetDerivativeWeights():确定值 x 的导数部分的权重

模板设置:

typedef itk::BSplineInterpolateImageFunction<InputImageType, double>InterpolatorType ;

4、itkWindowedSincInterpolateImageFunction 窗口化Sinc插值

该类使用加窗 sinc 函数进行插值。

与线性插值相比,该函数旨在提供具有最小混叠伪影的插值函数,根据采样理论,无限支持 sinc 滤波器(其傅里叶变换是盒式滤波器)对于函数重采样是最佳的,实际上,无限支持 sinc 滤波器是使用有限支持“窗口”sinc 滤波器来近似的。

在二维中,位置 (x,y) 处的插值由以下表达式给出:
在这里插入图片描述
其中 m 是窗口的“半径”(3,4 是合理的数字),K(t) 是核函数,由 sinc 函数和几个可能的窗口函数之一组成:
在这里插入图片描述
itk::Function 命名空间中提供了几个窗口函数。 参考论文的结论建议在 m = 4,5 时使用 Welch、Cosine、Kaiser 和 Lanczos 窗,这些是基于旋转医学图像的误差线性插值法,在某些情况下,结果的准确性提高了 20 倍。
能用interpolaterwindows包括:

  • Cosinus windo
    在这里插入图片描述

  • Hamming window
    在这里插入图片描述

  • Welch window
    在这里插入图片描述

  • Lancos window
    在这里插入图片描述

  • Blackman window
    在这里插入图片描述

这种方法可以通过窗函数控制插值结果的平滑程度,可以获得比线性插值更平滑的插值结果,但是计算速度较慢,且窗函数的选择可能会影响插值结果。

在设置模板类型时:itk::WindowedSincInterpolateImageFunction< TInputImage, VRadius, TWindowFunction, TBoundaryCondition, TCoordRep >
其中:

  • TInputImage:是图像类型,这是标准的。
  • VRadius:为kernel半径,例如上面公式中的m;
  • TWindowFunction:是window的函数对象,根据上述五中不同函数选择,默认为Hamming window,根据引用的论文,它很常用,但不是最佳的;
  • TBoundaryCondition:确定落在图像边缘的像素值boundary condition class
typedef itk::ConstantBoundaryCondition<InputImageType> BoundaryConditionType ;
constexpr unsigned int WindowRadius = 5;
typedef itk::Function::HammingWindowFunction<WindowRadius> WindowFunctionType ;
typedef itk::WindowedSincInterpolateImageFunction<InputImageType,WindowRadius,WindowFunctionType,BoundaryConditionType,double> InterpolatorType;

5、itkRayCastInterpolateImageFunction 投射插值

在指定位置对图像进行投影插值,它在图像中的光线路径上进行插值。

RayCastInterpolateImageFunction 通过 3 维图像投射光线,并使用双线性插值来整合所遍历的每个体素平面。

这种方法可以模拟投影像素在图像中的路径,从而产生更精确的插值结果。但是计算速度较慢。

警告
该插值器仅适用于 3 维图像。

  • SetTransform():设置连接变换,此变换用于计算新的焦点位置
  • GetModifiableTransform():获取连接变换,此变换用于计算新的焦点位置
  • Set/GetThreshold():设置/获取阈值,高于该阈值,沿射线路径的体素将被积分
  • SetInterpolator():连接插补器
  • GetModifiableInterpolator():获取指向插值器的指针
  • Set/GetFocalPoint():设置/获取射线源的焦点或位置
  • IsInsideBuffer():检查图像缓冲区内是否有连续索引 或 检查索引是否位于图像缓冲区内,考虑到每个体素的中心位于整数坐标并延伸到下一个整数坐标的一半

模板设置:

typedef itk::RayCastInterpolateImageFunction<InputImageType, double> RayCastInterpolateFunctionType;

6、itkGaussianInterpolateImageFunction 高斯插值

该类为图像的高斯插值。

此类使用 vnl 误差函数定义 N 维高斯插值函数,与该函数相关的两个参数是:

  • Sigma:大小为 ImageDimension 的标量数组,确定插值函数的宽度。
  • Alpha:指定计算函数的截止距离的标量。

该类对噪声具有平滑作用,插值结果更接近真实图像,但计算复杂度较高。

  • Set/GetSigma():设置/获取Sigma值
  • Set/GetAlpha():设置/获取Alpha值
  • SetParameters(RealType* sigma, RealType alpha ):设置/获取Sigma和Alpha值
  • SetCutOffDistance():设置/获取截止距离
  • SetBoundingBoxStart():设置/获取边界框起点
  • SetBoundingBoxEnd():设置/获取边界框终点
typedef itkGaussianInterpolateImageFunction<InputImageType, double>

这篇关于【ITK库学习】使用itk库进行图像配准:内插器(插值)的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/528478

相关文章

Android Paging 分页加载库使用实践

《AndroidPaging分页加载库使用实践》AndroidPaging库是Jetpack组件的一部分,它提供了一套完整的解决方案来处理大型数据集的分页加载,本文将深入探讨Paging库... 目录前言一、Paging 库概述二、Paging 3 核心组件1. PagingSource2. Pager3.

Python进行JSON和Excel文件转换处理指南

《Python进行JSON和Excel文件转换处理指南》在数据交换与系统集成中,JSON与Excel是两种极为常见的数据格式,本文将介绍如何使用Python实现将JSON转换为格式化的Excel文件,... 目录将 jsON 导入为格式化 Excel将 Excel 导出为结构化 JSON处理嵌套 JSON:

python使用try函数详解

《python使用try函数详解》Pythontry语句用于异常处理,支持捕获特定/多种异常、else/final子句确保资源释放,结合with语句自动清理,可自定义异常及嵌套结构,灵活应对错误场景... 目录try 函数的基本语法捕获特定异常捕获多个异常使用 else 子句使用 finally 子句捕获所

C++11右值引用与Lambda表达式的使用

《C++11右值引用与Lambda表达式的使用》C++11引入右值引用,实现移动语义提升性能,支持资源转移与完美转发;同时引入Lambda表达式,简化匿名函数定义,通过捕获列表和参数列表灵活处理变量... 目录C++11新特性右值引用和移动语义左值 / 右值常见的左值和右值移动语义移动构造函数移动复制运算符

Python对接支付宝支付之使用AliPay实现的详细操作指南

《Python对接支付宝支付之使用AliPay实现的详细操作指南》支付宝没有提供PythonSDK,但是强大的github就有提供python-alipay-sdk,封装里很多复杂操作,使用这个我们就... 目录一、引言二、准备工作2.1 支付宝开放平台入驻与应用创建2.2 密钥生成与配置2.3 安装ali

C#中lock关键字的使用小结

《C#中lock关键字的使用小结》在C#中,lock关键字用于确保当一个线程位于给定实例的代码块中时,其他线程无法访问同一实例的该代码块,下面就来介绍一下lock关键字的使用... 目录使用方式工作原理注意事项示例代码为什么不能lock值类型在C#中,lock关键字用于确保当一个线程位于给定实例的代码块中时

MySQL 强制使用特定索引的操作

《MySQL强制使用特定索引的操作》MySQL可通过FORCEINDEX、USEINDEX等语法强制查询使用特定索引,但优化器可能不采纳,需结合EXPLAIN分析执行计划,避免性能下降,注意版本差异... 目录1. 使用FORCE INDEX语法2. 使用USE INDEX语法3. 使用IGNORE IND

C# $字符串插值的使用

《C#$字符串插值的使用》本文介绍了C#中的字符串插值功能,详细介绍了使用$符号的实现方式,文中通过示例代码介绍的非常详细,需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习吧... 目录$ 字符使用方式创建内插字符串包含不同的数据类型控制内插表达式的格式控制内插表达式的对齐方式内插表达式中使用转义序列内插表达式中使用

flask库中sessions.py的使用小结

《flask库中sessions.py的使用小结》在Flask中Session是一种用于在不同请求之间存储用户数据的机制,Session默认是基于客户端Cookie的,但数据会经过加密签名,防止篡改,... 目录1. Flask Session 的基本使用(1) 启用 Session(2) 存储和读取 Se

Java Thread中join方法使用举例详解

《JavaThread中join方法使用举例详解》JavaThread中join()方法主要是让调用改方法的thread完成run方法里面的东西后,在执行join()方法后面的代码,这篇文章主要介绍... 目录前言1.join()方法的定义和作用2.join()方法的三个重载版本3.join()方法的工作原