R中seurat包函数FindMarkers报错Error in WhichCells.Seurat(object = object, idents = ident.1) :

本文主要是介绍R中seurat包函数FindMarkers报错Error in WhichCells.Seurat(object = object, idents = ident.1) :,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

在R中运行seurat包中的函数FindMarkers时,出现报错:

Error in WhichCells.Seurat(object = object, idents = ident.1) : 
  Cannot find the following identities in the object: 5

可能原因:seurat对象b已经被注释过,所以需要用注释后的名字,而不是最初以数字命名的cluster的名字,如

 

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