本文主要是介绍ubuntu(18.04) 安装 blast，希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值，需要的开发者们随着小编来一起学习吧！
1、下载
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
2、解压，配置环境变量
tar zvxf ncbi-blast-2.14.1+-x64-linux.tar.gz解压后改名为 blast配置环境变量，可以不配置 使用的时候直接绝对路径使用
vim ~/.bashrc 将下面添加道最后, dir 是解压文件所在的绝对路径，export BLAST_HOME=/dir/blast
export PATH=$PATH:/dir/blast/bin使配置生效source ~/.bashrc测试安装结果blastn -version 如果显示版本信息则说明可正常使用
3、创建数据库
在/dir/blast 下创建文件夹 db/mydb 用来存放不同的数据库
构建数据库：initdb.fasta 是用来构建数据库的源文件
#绝对路径调用，直接使用makeblastdb调用可能出现找不到命令的问题，可能是环境变量没有配置好/dir/blast/bin/makeblastdb -in /dir/blast/db/mydb/initdb.fasta -dbtype prot结果：
4、测试搜索 test.fasta 是测试序列文件
#采用绝对路径调用#结果输出到终端/dir/blast/bin/blastp -query /dir/blast/output/test.fasta -db /dir/blast/db/mydb/initdb.fasta -outfmt 6#结果输出到文件/dir/blast/bin/blastp -query /dir/blast/output/test.fasta -db /dir/blast/db/mydb/initdb.fasta -outfmt 6 -out /dir/blast/output/test结果：
5.在php中调用
这篇关于ubuntu(18.04) 安装 blast的文章就介绍到这儿，希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助！
