22. Lammps命令学习-7之read_restart

2024-09-02 03:36

本文主要是介绍22. Lammps命令学习-7之read_restart,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

来源: “码农不会写诗”公众号
链接:Lammps命令学习-6之read_data

read_restart file

  从restart文件中读取先前保存的系统配置从而可以继续先前的模拟。
  https://docs.lammps.org/read_restart.html


Syntax

read_restart file

Description
从restart文件中读取先前保存的系统配置从而可以继续先前的模拟。

此操作会重新创建模拟盒,包括其中所有的原子及其属性,以及一些相关的全局设置,所有这些设置会跟前一次模拟写入restart文件时一样。

read_restart file
  • file = name of binary restart file to read in

restart文件是二进制格式,可以使用lammps命令行-r2data参数将restart文件转换为data文件。
例如在以下情况都可以将其转化为data文件后使用:1. 在不同机器运行模拟,二进制文件可能无法通用时;2. 利用其他软件进行可视化或进行如原子筛选等后处理时。

lmp -h  # 查看lammps可执行文件帮助信息

通过以下命令之一可将restart文件(file.restart)转换为data文件(file.data)。

lmp -restart2data file.restart file.data
lmp -r2data file.restart file.data

以下是restart文件中已经存储的信息,即这些量在读取restart文件时,输入脚本中不需要重新指定。当然了,在读取restart文件后,可以重新定义这些设置中的许多项,比如将timestep重新设置为0等。

  • units
  • newton bond
  • atom style and atom_modify settings id, map, sort
  • comm style and comm_modify settings mode, cutoff, vel
  • simulation box size and shape and boundary settings
  • atom group definitions
  • per-type atom settings such as mass
  • per-atom attributes including their group assignments and molecular topology attributes (bonds, angles, etc)
  • force field styles (pair, bond, angle, etc)
  • force field coefficients (pair, bond, angle, etc) in some cases (see below)
  • pair_modify settings, except the compute option
  • special_bonds settings

以下是restart文件中未存储的信息,即在读取restart文件之后,必须在输入脚本中重新执行相关命令。

  • newton pair
  • fix commands
  • compute commands
  • variable commands
  • neighbor list criteria including neigh_modify settings
  • kspace_style and kspace_modify settings
  • info for thermodynamic, dump, or restart output

简而言之,与系统配置相关的信息会存储在restart文件中,否则将需要重新定义或设置。

关于更细节的知识,本系列不会用到,姑且不细讲,以后有机会再共同探讨。

Example

read_restart save.10000
read_restart restart.*

Default
none


书山有路勤为径,学海无涯苦作舟。今天就到这里啦,拜了个拜~

上一篇:Lammps命令学习-6之read_data

这篇关于22. Lammps命令学习-7之read_restart的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1128874

相关文章

Redis 的 SUBSCRIBE命令详解

《Redis的SUBSCRIBE命令详解》Redis的SUBSCRIBE命令用于订阅一个或多个频道,以便接收发送到这些频道的消息,本文给大家介绍Redis的SUBSCRIBE命令,感兴趣的朋友跟随... 目录基本语法工作原理示例消息格式相关命令python 示例Redis 的 SUBSCRIBE 命令用于订

防止Linux rm命令误操作的多场景防护方案与实践

《防止Linuxrm命令误操作的多场景防护方案与实践》在Linux系统中,rm命令是删除文件和目录的高效工具,但一旦误操作,如执行rm-rf/或rm-rf/*,极易导致系统数据灾难,本文针对不同场景... 目录引言理解 rm 命令及误操作风险rm 命令基础常见误操作案例防护方案使用 rm编程 别名及安全删除

Java使用jar命令配置服务器端口的完整指南

《Java使用jar命令配置服务器端口的完整指南》本文将详细介绍如何使用java-jar命令启动应用,并重点讲解如何配置服务器端口,同时提供一个实用的Web工具来简化这一过程,希望对大家有所帮助... 目录1. Java Jar文件简介1.1 什么是Jar文件1.2 创建可执行Jar文件2. 使用java

Unity新手入门学习殿堂级知识详细讲解(图文)

《Unity新手入门学习殿堂级知识详细讲解(图文)》Unity是一款跨平台游戏引擎,支持2D/3D及VR/AR开发,核心功能模块包括图形、音频、物理等,通过可视化编辑器与脚本扩展实现开发,项目结构含A... 目录入门概述什么是 UnityUnity引擎基础认知编辑器核心操作Unity 编辑器项目模式分类工程

Linux查询服务器 IP 地址的命令详解

《Linux查询服务器IP地址的命令详解》在服务器管理和网络运维中,快速准确地获取服务器的IP地址是一项基本但至关重要的技能,下面我们来看看Linux中查询服务器IP的相关命令使用吧... 目录一、hostname 命令:简单高效的 IP 查询工具命令详解实际应用技巧注意事项二、ip 命令:新一代网络配置全

Python学习笔记之getattr和hasattr用法示例详解

《Python学习笔记之getattr和hasattr用法示例详解》在Python中,hasattr()、getattr()和setattr()是一组内置函数,用于对对象的属性进行操作和查询,这篇文章... 目录1.getattr用法详解1.1 基本作用1.2 示例1.3 原理2.hasattr用法详解2.

Linux grep 命令的使用指南

《Linuxgrep命令的使用指南》本文给大家介绍Linuxgrep命令的使用指南,包括基础搜索语法、实践指南,感兴趣的朋友跟随小编一起看看吧... 目录linux grep 命令全面使用指南一、基础搜索语法1. 基本文本搜索2. 多文件搜索二、常用选项详解1. 输出控制选项2. 上下文控制选项三、正则表达

DNS查询的利器! linux的dig命令基本用法详解

《DNS查询的利器!linux的dig命令基本用法详解》dig命令可以查询各种类型DNS记录信息,下面我们将通过实际示例和dig命令常用参数来详细说明如何使用dig实用程序... dig(Domain Information Groper)是一款功能强大的 linux 命令行实用程序,通过查询名称服务器并输

setsid 命令工作原理和使用案例介绍

《setsid命令工作原理和使用案例介绍》setsid命令在Linux中创建独立会话,使进程脱离终端运行,适用于守护进程和后台任务,通过重定向输出和确保权限,可有效管理长时间运行的进程,本文给大家介... 目录setsid 命令介绍和使用案例基本介绍基本语法主要特点命令参数使用案例1. 在后台运行命令2.

Linux如何查看文件权限的命令

《Linux如何查看文件权限的命令》Linux中使用ls-R命令递归查看指定目录及子目录下所有文件和文件夹的权限信息,以列表形式展示权限位、所有者、组等详细内容... 目录linux China编程查看文件权限命令输出结果示例这里是查看tomcat文件夹总结Linux 查看文件权限命令ls -l 文件或文件夹