biostar handbook: 第三周笔记汇总+第四周任务布置

2024-06-23 21:18

本文主要是介绍biostar handbook: 第三周笔记汇总+第四周任务布置,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

就目前来看,这一周主要以补交上次作业为主,所以上一周的总结增加了很多新内容。但是关于本体论和富集分析,大家还是有点小困难。当然我自己交东西也慢了很多,因为时间也总是不太够,完全靠周末挤出来。

第三周笔记汇总如下

  • Biostar学习笔记(3)Gene set analysis related topics.
  • 本体论
  • biostarhandboo(四)|本体论和功能分析
  • 基因本体论

第四周作业发布

我们处在大数据时代,尤其是测序技术诞生之后,测序仪生产的数据更是不可思议地多。那么问题来了,我们每个人都在说数据,但是数据(data)是什么呢?还有一个问题数据格式(data format)又是什么?数据那么多,你需要的数据存放在哪里,你需要到哪里才能找到这些数据呢?这些都是你这一周需要思考的问题。

第四周的任务是阅读第六章和第七章的内容。这部分内容比较简单,都是属于了解即可的内容。此外,这一周涉及到命令行操作的代码也有很多,可能需要一段时间去练习。

  • 了解GenBank格式
  • 了解FASTA/FASTQ格式,尤其是FASTA的命名方式
  • 整理目前你已知的数据库
  • 学会使用命令行访问NCBI
  • 学会从数据库下载数据到本地,以SRA为例。

这篇关于biostar handbook: 第三周笔记汇总+第四周任务布置的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1088297

相关文章

一文详解MySQL如何设置自动备份任务

《一文详解MySQL如何设置自动备份任务》设置自动备份任务可以确保你的数据库定期备份,防止数据丢失,下面我们就来详细介绍一下如何使用Bash脚本和Cron任务在Linux系统上设置MySQL数据库的自... 目录1. 编写备份脚本1.1 创建并编辑备份脚本1.2 给予脚本执行权限2. 设置 Cron 任务2

Linux实现线程同步的多种方式汇总

《Linux实现线程同步的多种方式汇总》本文详细介绍了Linux下线程同步的多种方法,包括互斥锁、自旋锁、信号量以及它们的使用示例,通过这些同步机制,可以解决线程安全问题,防止资源竞争导致的错误,示例... 目录什么是线程同步?一、互斥锁(单人洗手间规则)适用场景:特点:二、条件变量(咖啡厅取餐系统)工作流

8种快速易用的Python Matplotlib数据可视化方法汇总(附源码)

《8种快速易用的PythonMatplotlib数据可视化方法汇总(附源码)》你是否曾经面对一堆复杂的数据,却不知道如何让它们变得直观易懂?别慌,Python的Matplotlib库是你数据可视化的... 目录引言1. 折线图(Line Plot)——趋势分析2. 柱状图(Bar Chart)——对比分析3

JAVA数组中五种常见排序方法整理汇总

《JAVA数组中五种常见排序方法整理汇总》本文给大家分享五种常用的Java数组排序方法整理,每种方法结合示例代码给大家介绍的非常详细,感兴趣的朋友跟随小编一起看看吧... 目录前言:法一:Arrays.sort()法二:冒泡排序法三:选择排序法四:反转排序法五:直接插入排序前言:几种常用的Java数组排序

防止SpringBoot程序崩溃的几种方式汇总

《防止SpringBoot程序崩溃的几种方式汇总》本文总结了8种防止SpringBoot程序崩溃的方法,包括全局异常处理、try-catch、断路器、资源限制、监控、优雅停机、健康检查和数据库连接池配... 目录1. 全局异常处理2. 使用 try-catch 捕获异常3. 使用断路器4. 设置最大内存和线

Django之定时任务django-crontab的实现

《Django之定时任务django-crontab的实现》Django可以使用第三方库如django-crontab来实现定时任务的调度,本文主要介绍了Django之定时任务django-cront... 目录crontab安装django-crontab注册应用定时时间格式定时时间示例设置定时任务@符号

Android实现定时任务的几种方式汇总(附源码)

《Android实现定时任务的几种方式汇总(附源码)》在Android应用中,定时任务(ScheduledTask)的需求几乎无处不在:从定时刷新数据、定时备份、定时推送通知,到夜间静默下载、循环执行... 目录一、项目介绍1. 背景与意义二、相关基础知识与系统约束三、方案一:Handler.postDel

Pandas中统计汇总可视化函数plot()的使用

《Pandas中统计汇总可视化函数plot()的使用》Pandas提供了许多强大的数据处理和分析功能,其中plot()函数就是其可视化功能的一个重要组成部分,本文主要介绍了Pandas中统计汇总可视化... 目录一、plot()函数简介二、plot()函数的基本用法三、plot()函数的参数详解四、使用pl

springboot使用Scheduling实现动态增删启停定时任务教程

《springboot使用Scheduling实现动态增删启停定时任务教程》:本文主要介绍springboot使用Scheduling实现动态增删启停定时任务教程,具有很好的参考价值,希望对大家有... 目录1、配置定时任务需要的线程池2、创建ScheduledFuture的包装类3、注册定时任务,增加、删

python获取网页表格的多种方法汇总

《python获取网页表格的多种方法汇总》我们在网页上看到很多的表格,如果要获取里面的数据或者转化成其他格式,就需要将表格获取下来并进行整理,在Python中,获取网页表格的方法有多种,下面就跟随小编... 目录1. 使用Pandas的read_html2. 使用BeautifulSoup和pandas3.