本文主要是介绍11. 利用MS为Lammps ReaxFF建模(PE/聚乙烯)基础-2，希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值，需要的开发者们随着小编来一起学习吧！
来源： “码农不会写诗”公众号
链接：利用MS为Lammps ReaxFF建模(PE/聚乙烯)基础-2
文章目录
- 01 msi2lmp工具简介
- 1. 编译生成msi2lmp可执行文件
- 2. 使用方式
- 02 赋予模型CVFF力场
- 03 导出car/mdf文件
- 04 生成data文件
- 05 data文件进一步处理
文接上篇
上篇利用Material Studio(MS)完成了PE体系（2条C150H300链）的建模和优化平衡（几何优化、模拟退火、动力学平衡）工作，本文借助msi2lmp工具将其转化为Lammps所支持的文件格式。
01 msi2lmp工具简介
Lammps提供的msi2lmp工具可以很方便的进行MS模型到Lammps data文件的转换。
1. 编译生成msi2lmp可执行文件
cd lammps/tools/msi2lmp/src # 修改为下载的lammps路径
make
不想编译怎么办？
关注公众号回复关键词：msi2lmp
2. 使用方式
msi2lmp.exe -h # 查看使用帮助
常用参数 :
– -ignore 忽略警告和报错信息
– -class 使用力场类别
– -frc 力场文件
02 赋予模型CVFF力场
若前面几何优化，退火，动力学等步骤未使用CVFF力场，会导致导出的car/mdf文件缺失如原子质量等信息，无法转换为data文件，所以导出car/mdf文件之前需要赋予CVFF力场。
Modules->Discover->Setup
Discover Setup-Energy
选择cvff力场
Discover Setup-Typeing
Calcculate 力场参数
03 导出car/mdf文件
File->Export->Insight Molecule Files
导出成功后，产生两个文件xxx.car和xxx.mdf
04 生成data文件
路径有空格需要引号包起来;
相对路径是当前路径起始，不确定时使用绝对路径；
msi2lmp.exe car/mdf文件路径（不带文件后缀） -class I -ignore -frc 力场文件路径
例：
./msi2lmp.exe ./pe -ignore -class I -frc ./frc_files/cvff.frc
05 data文件进一步处理
如此生成的data文件（如下图Masses部分）需要进一步处理以更好的服务于Lammps。这部分内容以后有机会再分享，另外AutoRMA也提供了此服务，朋友们可以期待一下子。
至此已经成功生成Lammps模拟所需要的data文件了。再次恭喜坚持学习到本节的朋友，从下节就正式进入Lammps命令相关的知识了。今天就到这里啦，有问题可后台或者评论哦，拜了个拜~
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